چکیده                         1                                                                     

   فصل اول: مقدمه  و اهداف                                                                              

1-1-  مقدمه                                                                                3

1-2-  دیدگاه نوین در برنامه های اصلاح نژادی اسب                              4

1-3-  اهداف پژوهش                                                                    4

فصل دوم: بررسی منابع

2-1-  اسب های ایران                                                                            6

2-1-1-  تاریخچه و خصوصیات اسب نژاد ترکمن                                6

2-1-1-1-  ویژگی های خاص اسب های ترکمن                                   8

2-1-1-2- خصوصیات ظاهری اسب ترکمن                                        8

2-1-1-3- پراکندگی اسب ترکمن                                                     10

2-1-1-4- تیره های اسب ترکمن                                                      10

2-1-2- تاریخچه و خصوصیات اسب نژاد عرب                                   10

2-1-2-1- مشخصات ظاهری اسب عرب                                           12

2-1-3- تاریخچه و خصوصیات اسب نژاد اسبچه خزر                                     14

2-1-3-1- خصوصیات ظاهری                                                       15

2-1-3-2- کاربری                                                                      17

2-1-3-3- پراکندگی                                                                     17

2-1-4- تاریخچه و خصوصیات اسب نژاد تروبرد                                 18     

2-1-4-1- منشاء اسب های تروبرد                                                   18

2-1-4-2- معرفی نژاد تروبرد                                                                  19

2-1-4-3- صفات ظاهری                                                              19

2-1-4-4- نقاط ضعف اسب تروبرد                                                  21

2-1-4-5- کاربری                                                                      21              

2-2- نقش بیوتکنولوژی در اصلاح نژاد اسب                                                21

2-3- استفاده از نشانگرهای مولکولی در برنامه های انتخاب اسب                        22     

2-3-1- اهمیت نشانگرهای مولکولی در اصلاح نژاد اسب                       22

2-4- نشانگرهای ژنتیکی                                                               23

2-5- واکنش زنجیره ای پلیمراز                                                      23

2-6- RFLP بر مبنای PCR                                                                   24

2-6-1- مزایای RFLP                                                                25

2-6-2- معایب RFLP                                                                 25

2-7- ژنوم اسب                                                                          25

2-8- رنگ های پایه                                                                     26

2-9- رقت ها                                                                                       27

2-9-1- ژن های رقت رنگ                                                           29

2-9-2- رقت کرم رنگ                                                                30

2-9-3- قهوه ای کمرنگ (سمند)                                                      30

2-9-4- شامپاینی                                                                         31

2-9-5- نقره ای (خالخالی)                                                             31

2-10- خالدارسازی رنگ سفید و الگوهای رنگدانه زدایی                        32

2-10-1- رنگ خاکستری                                                              32

2-10-2- رنگ بلوطی                                                                           35

2-10-3- کهر، سیاه (آگوتی)                                                          35

2-10-4- رنگ سفید                                                                    36

2-11- ژن MATP                                                                     36

2-11-1- بررسی چند شکلی های شناسایی شده ژن MATP                              37

فصل سوم: مواد و روش ها                                                                 

3-1- تهیه نمونه های تحقیق                                                           40

3-2- مشخصات صفت ثبت شده                                                       40

3-3- استخراج DNA                                                                  41

3-3-1- جزئیات و مراحل جداسازی DNA                                        41

3-3-1-1- لیز کردن سلول                                                             41

3-3-1-2- Binding DNA                                                          42

3-3-1-3- شستشو                                                                       42

3-3-1-4- DNA ELUTION                                                      42

3-4- تعیین کیفیت DNA                                                              43

3-5- روش اکتروفورز روی ژل آگاروز                                                      43

3-6- جایگاه مورد مطالعه                                                              43

3-7- اجزای واکنش PCR                                                             44

3-8- مراحل انجام واکنش PCR                                                      44

3-9- بهینه سازی واکنش PCR                                                       45

3-9-1- محاسبه ی دمای اتصال پرایمر                                                        45

3-9-2- تعیین غلظت MgCl                                                                   46

3-9-3- سیکل حرارتی PCR                                                                   46

3-10- الکروفورز محصول PCR                                                   46

3-11- هضم آنزیمی محصولات PCR                                              47

3-12- الکتروفورز محصولات حاصل از هضم آنزیمی   I509 Tsp                  48

فصل چهارم: نتیجه گیری و بحث

4-1- کیفیت DNA استخراجی                                                        50

4-2- واکنش زنجیره ای پلیمراز PCR                                              50 

4-3- هضم با آنزیم برشی I 509  Tsp و واکنش PCR-RFLP                          51

4-4- روش Sequencing